PLCG1-AS1 (PLCG1 antisense RNA 1)

symbol:
PLCG1-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
20q12
gene_family:
alias symbol:
TOP1-AS1
alias name:
None
entrez id:
101927117
ensembl gene id:
ENSG00000226648
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_109889
hgnc_id:
HGNC:40450
approved reserved:
2014-06-13
20q12

PLCG1-AS1是一个长链非编码RNA(lncRNA)基因,位于人类染色体20q13.33区域,与PLCG1基因(磷脂酶Cγ1)的反义链重叠。PLCG1-AS1通过调控PLCG1的表达参与多种生物学过程,包括细胞信号传导、增殖和分化。PLCG1本身是磷脂酶C家族的一员,负责水解磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸(PIP2)生成第二信使肌醇三磷酸(IP3)和二酰基甘油(DAG),从而激活钙信号和蛋白激酶C(PKC)通路,影响细胞生长、迁移和免疫反应。PLCG1-AS1可能通过表观遗传修饰或转录干扰调节PLCG1的表达水平。研究表明,PLCG1-AS1的异常表达与多种疾病相关,例如在乳腺癌中可能通过上调PLCG1促进肿瘤进展,而在某些神经系统疾病中其表达失调可能影响神经元功能。PLCG1基因家族的共性在于它们编码的酶均参与细胞内信号转导,通过调控磷脂代谢影响下游通路。PLCG1-AS1过表达可能增强PLCG1介导的信号传导,导致细胞过度增殖或迁移,而降低表达则可能削弱相关通路,影响正常细胞功能。突变或表观遗传沉默可能破坏PLCG1-AS1与PLCG1的调控关系,进而引发疾病。目前研究仍在探索PLCG1-AS1的具体机制及其作为疾病标志物或治疗靶点的潜力。

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PLCG1-AS1基因的碱基序列:[NCBI]
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PLCG1-AS1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs15476       rs742210       rs1041953       rs1042234       rs1042366       rs1061982       rs1980456       rs2066906       rs2235362       rs2294975       rs3092210       rs3180629       rs3180630       rs3833886       rs4142394       rs4142395       rs4142396      

PLCG1-AS1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAGTTGCTAAGATCTAAGGCAG
59
CCTCATTACTGAAGGATCTTTCTG
59
TGTCTGACATGTTGAGCCA
59
GACCATCATTCCTCTGAAATGC
60
CTGTCTGACATGTTGAGCC
59
ACCATCATTCCTCTGAAATGC
59
      尚未收录相关数据

PLCG1-AS1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PLCG1-AS1基因的本体(GO)信息:

可能调控 PLCG1-AS1基因的相关microRNA:     

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关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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