GEO 表达数据分析

输入 GSE 编号 → 自动下载数据与平台注释 → 提取 eSet 与 pData → AI 推荐分组列 → 预处理输出标准 eSet → 差异基因+通路分析

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GSE32537 示例结果
以下为示例数据(肺纤维化 IPF vs 对照,169 样本),仅作展示不可交互;登录后每天可免费试用一次分析你自己的 GSE 数据集。

数据概况

平台:GPL6244 样本数:169 基因数:20,155 pData:169 行 × 12 列

pData 预览(前 4 行)

geo_accessionfinal diagnosis:ch1gender:ch1age (yrs):ch1tissue:ch1
GSM807123controlMale63Lung
GSM807124controlFemale58Lung
GSM807171IPFMale67Lung
GSM807172IPFFemale71Lung

AI 推荐分组列

推荐使用 final diagnosis:ch1 ★ 作为分组列(control 50 例 / IPF 119 例,组间均衡且与研究方向直接相关);gender、age 可作为协变量。

差异基因分析(示例)

上调:812 下调:635 |logFC| > 0.5, adj.P < 0.01

通路富集(示例,前 5 条)

通路来源adj.P基因数
Extracellular matrix organizationGO:BP1.2e-1868
Collagen fibril organizationGO:BP4.5e-1432
ECM-receptor interactionKEGG2.1e-1141
Focal adhesionKEGG8.7e-1055
Protein digestion and absorptionKEGG3.4e-0838
结果下载: pData.csv 差异基因.csv eSet.RData

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